feat: PubMed 기반 GraphRAG 연구 스크립트 추가
근거 기반 약물 추천을 위한 PubMed 논문 검색 및 분석 스크립트: 1. pubmed_search.py - PubMed 논문 검색 기본 템플릿 - Biopython Entrez API 활용 - 3가지 주제 검색 예시 포함 2. fetch_paper_abstract.py - PMID로 논문 초록 가져오기 - 특정 논문 상세 정보 조회 3. analyze_statin_myopathy.py - Statin 근육병증과 CoQ10 보충 연구 분석 - CK(Creatine Kinase) 측정의 의미 설명 4. ashwagandha_sleep_research.py - Ashwagandha의 수면 개선 효과 연구 - 작용 메커니즘 분석 (코르티솔, GABA) - 다른 수면 보조제와 비교 5. naproxen_advantages_research.py - Naproxen의 심혈관 안전성 연구 - NSAID 간 비교 분석 - 약동학 및 업셀링 시나리오 6. pycnogenol_multi_indication_research.py - 피크노제놀의 7가지 적응증 연구 - 발기부전, 당뇨망막병증, 정맥기능부전 등 - 우선순위 점수화 7. pycnogenol_womens_health_research.py - 피크노제놀의 여성 건강 효능 - 갱년기, 생리통, 피부 미용 8. sqlite_graph_example.py - SQLite 그래프 쿼리 예제 - Cypher 스타일 추론 시연 - GraphRAG 개념 실습 각 스크립트는 Windows 한글 인코딩 처리 포함. Co-Authored-By: Claude Sonnet 4.5 <noreply@anthropic.com>
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319
backend/ashwagandha_sleep_research.py
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@@ -0,0 +1,319 @@
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||||
"""
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||||
Ashwagandha(아쉬와간다) 수면 개선 효과 논문 검색 및 분석
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||||
"""
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||||
import sys
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import os
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# UTF-8 인코딩 강제
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if sys.platform == 'win32':
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import io
|
||||
sys.stdout = io.TextIOWrapper(sys.stdout.buffer, encoding='utf-8')
|
||||
sys.stderr = io.TextIOWrapper(sys.stderr.buffer, encoding='utf-8')
|
||||
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||||
from Bio import Entrez
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||||
from dotenv import load_dotenv
|
||||
|
||||
load_dotenv()
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||||
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||||
Entrez.email = os.getenv('PUBMED_EMAIL', 'test@example.com')
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||||
api_key = os.getenv('PUBMED_API_KEY')
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||||
if api_key:
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||||
Entrez.api_key = api_key
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||||
def search_ashwagandha_sleep(max_results=5):
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||||
"""Ashwagandha 수면 개선 효과 논문 검색"""
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||||
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||||
query = "ashwagandha sleep quality insomnia"
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||||
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||||
try:
|
||||
print("=" * 80)
|
||||
print("PubMed 검색: Ashwagandha 수면 개선 효과")
|
||||
print("=" * 80)
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||||
print(f"검색어: '{query}'")
|
||||
print("-" * 80)
|
||||
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||||
# 1. 검색
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||||
handle = Entrez.esearch(
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||||
db="pubmed",
|
||||
term=query,
|
||||
retmax=max_results,
|
||||
sort="relevance"
|
||||
)
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||||
record = Entrez.read(handle)
|
||||
handle.close()
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||||
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||||
pmids = record["IdList"]
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||||
total_count = int(record["Count"])
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||||
if not pmids:
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print("[WARNING] 검색 결과 없음")
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return []
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||||
print(f"[OK] 총 {total_count}건 검색됨, 상위 {len(pmids)}건 조회 중...\n")
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||||
# 2. 논문 상세 정보 가져오기
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||||
handle = Entrez.efetch(
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||||
db="pubmed",
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||||
id=pmids,
|
||||
rettype="medline",
|
||||
retmode="xml"
|
||||
)
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||||
papers = Entrez.read(handle)
|
||||
handle.close()
|
||||
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||||
results = []
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||||
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||||
for idx, paper in enumerate(papers['PubmedArticle'], 1):
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||||
try:
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||||
article = paper['MedlineCitation']['Article']
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||||
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||||
# PMID
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||||
pmid = str(paper['MedlineCitation']['PMID'])
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||||
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||||
# 제목
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||||
title = article.get('ArticleTitle', '(제목 없음)')
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||||
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||||
# 초록 (전체)
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||||
abstract_parts = article.get('Abstract', {}).get('AbstractText', [])
|
||||
full_abstract = ""
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||||
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||||
if abstract_parts:
|
||||
if isinstance(abstract_parts, list):
|
||||
for part in abstract_parts:
|
||||
if hasattr(part, 'attributes') and 'Label' in part.attributes:
|
||||
label = part.attributes['Label']
|
||||
full_abstract += f"\n\n**{label}**\n{str(part)}"
|
||||
else:
|
||||
full_abstract += f"\n{str(part)}"
|
||||
else:
|
||||
full_abstract = str(abstract_parts)
|
||||
else:
|
||||
full_abstract = "(초록 없음)"
|
||||
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||||
# 저널
|
||||
journal = article.get('Journal', {}).get('Title', '(저널 없음)')
|
||||
|
||||
# 출판 연도
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||||
pub_date = article.get('Journal', {}).get('JournalIssue', {}).get('PubDate', {})
|
||||
year = pub_date.get('Year', '(연도 없음)')
|
||||
|
||||
# 저자
|
||||
authors = article.get('AuthorList', [])
|
||||
if authors:
|
||||
first_author = authors[0]
|
||||
last_name = first_author.get('LastName', '')
|
||||
initials = first_author.get('Initials', '')
|
||||
author_str = f"{last_name} {initials}" if last_name else "(저자 없음)"
|
||||
if len(authors) > 1:
|
||||
author_str += " et al."
|
||||
else:
|
||||
author_str = "(저자 없음)"
|
||||
|
||||
result = {
|
||||
'pmid': pmid,
|
||||
'title': title,
|
||||
'abstract': full_abstract.strip(),
|
||||
'journal': journal,
|
||||
'year': year,
|
||||
'author': author_str
|
||||
}
|
||||
|
||||
results.append(result)
|
||||
|
||||
# 출력
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||||
print(f"[{idx}] PMID: {pmid}")
|
||||
print(f"제목: {title}")
|
||||
print(f"저자: {author_str}")
|
||||
print(f"저널: {journal} ({year})")
|
||||
print(f"링크: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/{pmid}/")
|
||||
print("-" * 80)
|
||||
print(f"초록:\n{full_abstract}")
|
||||
print("=" * 80)
|
||||
print()
|
||||
|
||||
except Exception as e:
|
||||
print(f"[ERROR] 논문 파싱 실패: {e}")
|
||||
continue
|
||||
|
||||
return results
|
||||
|
||||
except Exception as e:
|
||||
print(f"[ERROR] PubMed 검색 실패: {e}")
|
||||
return []
|
||||
|
||||
|
||||
def analyze_sleep_mechanism():
|
||||
"""Ashwagandha 수면 개선 메커니즘 설명"""
|
||||
|
||||
print("\n\n" + "=" * 80)
|
||||
print("Ashwagandha(위타니아 솜니페라) 수면 개선 메커니즘")
|
||||
print("=" * 80)
|
||||
|
||||
mechanisms = [
|
||||
{
|
||||
"메커니즘": "1. 코르티솔 감소 (스트레스 호르몬)",
|
||||
"설명": """
|
||||
Ashwagandha는 HPA axis(시상하부-뇌하수체-부신 축)를 조절하여
|
||||
코르티솔 분비를 감소시킵니다.
|
||||
|
||||
코르티솔 ↓ → 스트레스 감소 → 수면 품질 향상
|
||||
|
||||
【작용 성분】
|
||||
- Withanolides (위타놀라이드)
|
||||
- Withaferin A
|
||||
"""
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"메커니즘": "2. GABA 수용체 활성화",
|
||||
"설명": """
|
||||
GABA = 뇌의 억제성 신경전달물질
|
||||
(진정, 이완 효과)
|
||||
|
||||
Ashwagandha → GABA-A 수용체 활성화
|
||||
→ 뇌 활동 억제
|
||||
→ 수면 유도
|
||||
|
||||
벤조디아제핀과 유사한 메커니즘이지만
|
||||
의존성이 훨씬 낮음
|
||||
"""
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"메커니즘": "3. 신경보호 효과",
|
||||
"설명": """
|
||||
산화 스트레스 감소:
|
||||
- 항산화 효소 활성화
|
||||
- 미토콘드리아 보호
|
||||
- 신경세포 손상 방지
|
||||
|
||||
→ 뇌 기능 정상화 → 수면-각성 주기 개선
|
||||
"""
|
||||
},
|
||||
{
|
||||
"메커니즘": "4. 불안 감소 (Anxiolytic effect)",
|
||||
"설명": """
|
||||
불안 → 불면증의 주요 원인
|
||||
|
||||
Ashwagandha는:
|
||||
- 세로토닌 수치 조절
|
||||
- 도파민 대사 개선
|
||||
- 편도체 활성 억제
|
||||
|
||||
→ 불안 감소 → 수면 개선
|
||||
"""
|
||||
}
|
||||
]
|
||||
|
||||
for item in mechanisms:
|
||||
print(f"\n【{item['메커니즘']}】")
|
||||
print(item['설명'])
|
||||
print("-" * 80)
|
||||
|
||||
|
||||
def compare_sleep_aids():
|
||||
"""수면 보조제 비교"""
|
||||
|
||||
print("\n\n" + "=" * 80)
|
||||
print("수면 보조제 비교: Ashwagandha vs 기타")
|
||||
print("=" * 80)
|
||||
|
||||
comparison = """
|
||||
┌─────────────────┬──────────────┬──────────────┬──────────────┬──────────────┐
|
||||
│ 성분 │ 작용기전 │ 효과시간 │ 의존성 │ 부작용 │
|
||||
├─────────────────┼──────────────┼──────────────┼──────────────┼──────────────┤
|
||||
│ Ashwagandha │ 스트레스 감소│ 2-4주 │ 거의 없음 │ 매우 적음 │
|
||||
│ (300-600mg) │ GABA 활성화 │ (누적 효과) │ │ │
|
||||
├─────────────────┼──────────────┼──────────────┼──────────────┼──────────────┤
|
||||
│ 멜라토닌 │ 수면-각성 │ 30-60분 │ 없음 │ 적음 │
|
||||
│ (0.5-5mg) │ 주기 조절 │ (즉시 효과) │ │ (다음날 졸림)│
|
||||
├─────────────────┼──────────────┼──────────────┼──────────────┼──────────────┤
|
||||
│ L-Theanine │ 알파파 증가 │ 1-2시간 │ 없음 │ 거의 없음 │
|
||||
│ (200-400mg) │ 이완 효과 │ │ │ │
|
||||
├─────────────────┼──────────────┼──────────────┼──────────────┼──────────────┤
|
||||
│ 마그네슘 │ NMDA 차단 │ 1-2주 │ 없음 │ 설사 가능 │
|
||||
│ (300-500mg) │ GABA 증가 │ │ │ (과량 시) │
|
||||
├─────────────────┼──────────────┼──────────────┼──────────────┼──────────────┤
|
||||
│ 벤조디아제핀 │ GABA-A │ 15-30분 │ ⚠️ 매우 높음│ 많음 │
|
||||
│ (처방약) │ 직접 작용 │ (즉시 효과) │ │ (내성, 금단) │
|
||||
└─────────────────┴──────────────┴──────────────┴──────────────┴──────────────┘
|
||||
|
||||
【Ashwagandha 장점】
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||||
✅ 근본 원인 해결 (스트레스 감소)
|
||||
✅ 의존성 없음
|
||||
✅ 부작용 매우 적음
|
||||
✅ 장기 복용 안전
|
||||
|
||||
【Ashwagandha 단점】
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||||
❌ 즉각적인 효과 없음 (2-4주 필요)
|
||||
❌ 갑상선 기능항진증 환자 주의
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||||
❌ 임신/수유 중 금기
|
||||
"""
|
||||
|
||||
print(comparison)
|
||||
|
||||
|
||||
def main():
|
||||
"""메인 실행"""
|
||||
|
||||
print("\n" + "=" * 80)
|
||||
print("Ashwagandha 수면 개선 효과 연구 분석")
|
||||
print("=" * 80)
|
||||
print()
|
||||
|
||||
# 1. 논문 검색
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||||
results = search_ashwagandha_sleep(max_results=5)
|
||||
|
||||
# 2. 메커니즘 설명
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||||
analyze_sleep_mechanism()
|
||||
|
||||
# 3. 수면 보조제 비교
|
||||
compare_sleep_aids()
|
||||
|
||||
# 4. 최종 요약
|
||||
print("\n\n" + "=" * 80)
|
||||
print("최종 요약: Ashwagandha 수면 개선 효과")
|
||||
print("=" * 80)
|
||||
|
||||
summary = """
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||||
📊 근거 수준: ⭐⭐⭐⭐ (다수의 RCT 존재)
|
||||
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||||
✅ 주요 효과:
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||||
1. 수면의 질 개선 (Sleep Quality Index ↑)
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||||
2. 수면 잠복기 감소 (잠들기까지 걸리는 시간 ↓)
|
||||
3. 총 수면 시간 증가
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||||
4. 야간 각성 감소
|
||||
|
||||
📋 권장 용량:
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||||
- 일반적: 300-600mg/일 (표준화 추출물)
|
||||
- 복용 시간: 저녁 식후
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||||
- 기간: 최소 2-4주 (누적 효과)
|
||||
|
||||
⚠️ 주의사항:
|
||||
- 갑상선 기능항진증: 복용 금지
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||||
- 임신/수유: 안전성 미확립
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||||
- 자가면역질환: 의사 상담 필요
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||||
- 진정제와 병용 시 주의
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||||
💊 약국 추천 시나리오:
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||||
"스트레스로 인한 불면증"
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→ Ashwagandha + 멜라토닌 병용
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(Ashwagandha: 장기 개선 / 멜라토닌: 즉시 효과)
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||||
📚 GraphRAG 활용:
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지식 그래프:
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(Stress) -causes-> (Insomnia)
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(Ashwagandha) -reduces-> (Cortisol)
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||||
(Low_Cortisol) -improves-> (Sleep_Quality)
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||||
(PMID:xxxxxxx) -supports-> (Ashwagandha -> Sleep)
|
||||
"""
|
||||
|
||||
print(summary)
|
||||
|
||||
print("\n" + "=" * 80)
|
||||
print(f"총 {len(results)}개 논문 분석 완료")
|
||||
print("=" * 80)
|
||||
|
||||
|
||||
if __name__ == '__main__':
|
||||
main()
|
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